En los inicios de los años 60´s ante la demanda creciente de escuelas derivado del alto número de alumnos no admitidos por falta capacidad en la escuela vocacional, preparatoria Jalisco, preparatoria 2, el entonces rector en turno de la Universidad de Guadalajara Dr. Roberto Mendiola Orta, preocupado por el incremento al presupuesto universitario y por obtener resultados en materia académica e infraestructura, vio la necesidad de crear nuevas preparatorias, motivo por el cual gestiono con el Gobernador Constitucional en turno Don Juan Gil Preciado, la creación de la escuela Preparatoria N° 3, obteniendo con éxito el apoyo con el recurso económico.
La escuela preparatoria N° 3 fue fundada el 03 de noviembre de 1963, en el marco de un proceso de expansión de nuestra Universidad, según dictamen de fecha 25 de septiembre de 1963 aprobado por el H. Consejo General Universitario.
Inicio sus funciones en el edificio de la antigua escuela “Leona Vicario” situado en las calles de Liceo y Juan Álvarez, hoy Edificio Cultural y Administrativo “Valentín Gómez Farías”, a partir del año escolar 1963-1964, con personal propio (Docente, administrativo y de servicio) en dos turnos, matutino y vespertino, con una capacidad de admisión de 250 plazas en cada turno, haciendo un total de 500 lugares, teniéndose en el primer año una matrícula de 350 alumnos para ambos turnos.
Con un programa de estudios de 24 materias, en el primer y segundo año 1 y dos materias opcionales respectivamente y una de adiestramiento.
La primer planta magisterial estuvo integrada por 27 profesores, estando al frente de la dirección el Lic. Alberto Rosas Benítez y en la Secretaría el Lic. Antonio Aceves Fernández.
En 50 años sólo han transitado 9 Directores por esta Preparatoria, siendo éstos:
1963-1964.- Lic. Alberto Rosas Benítez
1964-1971.- Lic. Reyes Rodolfo Flores Zaragoza
1971-1983.- Lic. Antonio Aceves Fernández
1983-1984.- Lic. Felipe Rosas Segura
1984-1992.- Ing. Luis Ramírez Esparza
1992-1995.- Dr. Jaime Orea Marín
1195-2004.- Lic. J. Jesús González Ramos
2004-2013.- Mtro. José Guadalupe Torres Santiago
2013- Mtro. Carlos Eusebio Márquez Villarreal
Desde sus inicios la Preparatoria N° 3 se ha caracterizado por ser una escuela de tradición educativa, reconocida por quienes viven en la comunidad, de la que han egresado una gran cantidad de alumnos de los cuales algunos han logrado destacar en la comunidad jalisciense en los ámbitos, educativo, político, deportivo, artístico, y cultural.
Esta dependencia de la Universidad de Guadalajara, ha contribuido históricamente para combatir la exclusión educativa de esta zona en la que fue fundada, aspecto que se refleja a través de las distintas modalidades de educación media superior que se imparten, el bachillerato presencial y a partir del 2002 inicia la modalidad semiescolarizada, nombrada ahora Bachillerato General por Áreas Interdisciplinarias.
El 2004 fue un año significativo para la institución, puesto que se presentó el Proyecto Integral de Mejora de la Escuela Preparatoria, dando paso a la creación de espacios como: Colegio Departamental, Sala de Maestros, Sala Audiovisual, Área de Orientación Educativa, Administración del BGAI, así como la realización de la remodelación de Aulas, Sanitarios de alumnos, fachada e ingreso del plantel, y también del Auditorio “América Latina Revolucionaria”; se da por terminado este proyecto en 2009, agregando un área más, el Centro de Autoacceso.
